W Nadleśnictwie Ełk 62% drzewostanów ma charakter lasów ochronnych i obszarów chronionych.
Lasy stanowiące ostoję zwierzyny chronionej zajmują obszar około 50 ha. Do gatunków ptactwa objętych ochroną na tym terenie zalicza się orła bielika, cietrzewia, bociana czarnego, puchacza i żurawia. Zwierzętami podlegającymi ochronie są między innymi bóbr europejski, wydra, kumak nizinny, traszka grzebieniasta i czerwończyk nieparek.
Według inwentaryzacji na terenie Nadleśnictwa Ełk stwierdzono liczne występowanie sarny, dzika, lisa oraz mniej liczne łosia i jelenia. Wychodząc naprzeciw narastającym potrzebom w zakresie edukacji ekologicznej Nadleśnictwo Ełk urządziło leśne ścieżki dydaktyczne, które umożliwiają poznawanie przyrody w bezpośrednim z nią kontakcie, czyniąc kształcenie efektywniejszym i ciekawszym.
Obiektem o dużych walorach przyrodniczych jest przylegający do jeziora Selment Wielki park w Mrozach Wielkich. Rosną tutaj ponad 100-letnie drzewa, a do najciekawszych należy osiem 150-letnich dębów i klonów. Niektóre przekraczają 20 m wysokości. Ciekawostką jest dziewięć lip liczących ponad 100 lat, których pnie tworzą niejako jedną całość.
